表参道・原宿の東京原宿クリニックの院長、篠原です。

「お腹が張って苦しい」「下痢と便秘を繰り返す」 その不調、”いつものこと”だと諦めていませんか?
もしかしたら、原因はSIBO(シーボ)という、小腸の細菌バランスの乱れかもしれません。
SIBOは自己判断で改善するのが難しく、放置すると全身の不調につながることも。しかし、原因を正しく突き止めれば、その長年の苦しみから解放される可能性は十分にあります。
この記事では、専門医がSIBOの原因から最新の検査・治療法まで、解決への道を分かりやすく解説します。
もし、本気でこのSIBOという状態を理解し、根本的な改善を目指したいとお考えでしたら、当院の栄養療法外来を以下よりご検討ください。

Contents
SIBO(小腸内細菌異常増殖)とは?
SIBO(Small Intestinal Bacterial Overgrowth、シーボ)とは、小腸に本来よりも多くの細菌が増殖し、消化機能や栄養吸収に悪影響を及ぼす状態を指します。小腸は本来、食物の栄養を効率的に吸収する場ですが、細菌が過剰繁殖すると糖質やタンパク質が小腸内で発酵されてしまいます。その結果、大量のガスが発生して小腸が膨張し、お腹の張り(腹部膨満感)や下痢・便秘の便通異常、腹痛など様々な症状を引き起こします。重症の場合は栄養の吸収不良により貧血や体重減少、ビタミン不足など全身状態にも影響が及ぶことがあります。放置すると、細菌の毒素やバイオフィルムによって小腸粘膜が傷つき、腸管壁浸漏症候群(リーキーガット症候群)を引き起こし、体内に異物が入りやすくなることでアレルギー反応の原因となることもあります。
近年、「腸活」や「菌活」といった言葉がブームになり、発酵食品やプロバイオティクス(善玉菌サプリメント)を積極的に摂る健康法が注目されています。しかしSIBOの場合には、こうした腸活がかえって症状悪化につながることがあります。善かれと思って摂った納豆やヨーグルト・味噌・キムチなどの発酵食品で余計にお腹が張ってしまうケースもあるのです。クリニックなどで「ビオスリー」などの整腸剤を処方され、余計にお腹が張ってしまう場合もよく出会います。そのため、「自分の腸内環境を正しく知ること」がSIBO改善の第一歩となります。

SIBOの原因
SIBOを発症・悪化させる背景には、次のような要因が考えられます(複数の要因が重なるケースもあります)。
- 胃酸の低下 加齢や萎縮性胃炎、胃酸抑制薬(PPI)の長期使用により胃酸が減少すると、小腸へ侵入する細菌を抑える防御力が低下し、細菌の過剰増殖を招きます。ピロリ菌感染によって胃酸が弱まっている場合も同様です。胸焼けやげっぷといった症状に対し、逆流性食道炎と診断されて胃酸抑制剤が処方されることがありますが、その症状がSIBOによるガスの逆流である場合、胃酸抑制剤の使用はSIBOをさらに悪化させる可能性があります。
- 小腸の蠕動運動低下(消化管運動の低下)ストレスや慢性的な疲労、自律神経の乱れ、糖尿病や甲状腺機能低下症などの全身疾患により小腸の動き(ぜん動運動)が鈍くなると、内容物が長時間小腸内に停滞して細菌が増えやすくなります。特に、胃から小腸への内容物の輸送や細菌のクリアランスに関わるMMC(伝播性消化管収縮運動)が、炎症、感染、抗生物質の使用などによってうまく働かない場合もSIBOの原因となり得ます。ストレスや睡眠不足は腸の運動を低下させるため注意が必要です。
- 腸内フローラの乱れ(ディスバイオシス)抗生物質の乱用、不適切な食生活、強いストレスなどによって腸内細菌のバランスが崩れると、大腸の細菌が小腸へ逆流しやすくなったり、悪玉菌やカンジダなど真菌が優勢になったりします。その結果、小腸内で異常発酵が起こりSIBOに陥りやすくなります。
- 回盲弁の機能不全や手術後の消化管構造変化 盲腸(虫垂)の摘出術や腸の手術などで回盲弁が傷ついた場合、大腸側から小腸への内容物の逆流が起こりやすくなり、SIBO発症のリスクが上がります。回盲弁は小腸と大腸の境界にあり、大腸からの細菌の逆流を防いでいますが、手術だけでなく炎症やがんなどによっても機能不全を起こすことがあります。消化管の形態変化や癒着による通過障害も、小腸内容物のうっ滞と細菌増殖を招くことがあります。
- 胆汁の分泌低下
胆汁には抗菌作用があり、小腸内の細菌増殖を抑える役割があります。胆汁は胆嚢で濃縮されることでその抗菌作用が高まるため、胆嚢摘出術を受けた方などは胆汁が十分に濃縮されず、SIBOのリスクが上がることがあります。
こうした要因が一つではなく複合的に重なってSIBOを発症・再発するケースが多いため、原因に合わせた個別の対策が重要です。

SIBOの主な症状
SIBOによって起こりやすい主な症状は以下の通りです。
- 腹部膨満感・ガス過多(食後にお腹がパンパンに張る、頻繁におならやげっぷが出る)特に、納豆、ヨーグルトやキムチといった発酵性の食品など、特定の食事を摂った後に症状が悪化する場合、SIBOの可能性が高まります。
- 便通異常(下痢または便秘、あるいは下痢と便秘を繰り返す)
- 腹痛・腹部不快感(差し込むような痛みや重苦しい不快感)
- 栄養吸収不良による症状(原因不明の体重減少、貧血傾向、ビタミンB12不足による倦怠感など)増殖した細菌に摂取した栄養素(アミノ酸、ビタミン、ミネラルなど)が横取りされてしまうため、栄養不足に陥りやすくなります。
- 全身の症状(慢性的な疲労感、集中力低下、肌荒れ、頭痛 など)栄養吸収障害やリーキーガット症候群から派生するアレルギー反応、それらに伴う副腎疲労などにより、疲れやすさ、アレルギー症状、不眠といった全身の多様な不調が現れることもあります。
SIBOが進行するとブレインフォグ(脳の霧)と呼ばれる症状、すなわち「頭がぼーっとして集中できない」状態をきたすこともあります。

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SIBOセルフチェック
「もしかしてSIBOかも?」と思ったら、以下のセルフチェックで当てはまる項目がどのくらいあるか確認してみましょう。「SIBOの可能性が考えられる」という判定になった方は来院をおすすめします。
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動画で解説
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SIBOと過敏性腸症候群(IBS)の違い
過敏性腸症候群(IBS)はストレスなどが引き金となり腸の機能が乱れて、下痢や便秘、腹痛をきたす機能性の疾患です。一方、SIBOは小腸内の細菌異常増殖が主な原因であり、診断の考え方が異なります。ただし症状が非常に似通っているため見分けが難しく、実際にはIBS患者の約3~8割がSIBOを合併しているとの研究報告もあります(論文)。IBSの治療(例えば腸の運動を整える薬など)では改善しなかった人が、SIBOの治療(抗菌薬や低FODMAP食など)で症状が大きく改善するケースも多く報告されています。こうしたことから、近年IBSとSIBOの関連性が注目されています。
当院でも、症状がIBSと診断されている方で実はSIBOが隠れているケースを多く経験します。そのためIBSとSIBOを厳密に切り分けるよりも、総合的に腸内環境を検査し、問題となっている菌の有無に応じて治療を行うアプローチをとっています。
SIBOの検査方法
SIBOが疑われる場合、以下のような検査によって診断や原因菌の特定を行います。当院では非侵襲的な検査を組み合わせて、総合的に腸内環境を評価しています。
- 呼気ガス検査(ラクトゥロース・グルコース呼気試験)
- 糖質(試薬)を服用後、一定時間ごとに吐く息に含まれる水素ガス・メタンガスの濃度を測定します。小腸で細菌が過剰発酵している場合、通常より早いタイミングでガス濃度が上昇するためSIBOの診断に有用です。ただしどの種類の菌が増えているか特定できないため、当院ではこの呼気検査単独での診断はあまり用いておらず、後述のGIMAP検査などによる詳細分析を主に行っています。また、日本ではこの呼気試験は保険適用外(自費検査)で実施施設も限られているのが現状です。
- 便中細菌叢解析(GIMAP検査など)
- 患者様の便サンプルから腸内細菌のDNAを網羅的に調べ、菌種ごとのバランスや病原菌・カビの有無を解析します。GIMAP検査は「定量的リアルタイムPCR検査」という遺伝子解析技術を用い、腸内細菌のバランスだけでなく、特定の病原菌(ピロリ菌を含む)、善玉菌、日和見菌の状態、消化吸収能力、腸の炎症状態、腸管の免疫状態などを一覧で把握することが可能です。SIBOの原因となっている細菌やカビ(真菌)が特定できれば、それに応じて治療方針を個別化することが可能です。当院ではこのGIMAP検査をSIBOの評価に積極的に活用しています。ただし、GIMAP検査はカンジダなどの真菌を見つける能力が比較的低いとされるため、カンジダの関与が疑われる場合は、後述の尿中有機酸検査を併用することを推奨しています。また、近年利用可能になったStoolOMXを追加することで、胆汁酸と短鎖脂肪酸を評価し、より腸内環境改善に有用です。
- 尿中有機酸検査(OAT)
- 尿中に排出される有機酸(体内代謝産物)を分析することで、ビタミンや腸内環境の状態を評価する検査です。特に腸カンジダなど真菌由来の代謝物も測定できるため、小腸内真菌増殖症(SIFO)との鑑別に有用です。SIBOとSIFOは症状が似ているため見逃されがちですが、有機酸検査により真菌の関与を把握できます。当院では、特に腹部膨満感が強い場合など、症状に応じてGIMAP検査とこの有機酸検査の組み合わせをおすすめすることが多いです。

当院ではGIMAP検査や有機酸検査を組み合わせた個別アプローチを行っており、いわば「呼気ガス検査では分からない原因」まで徹底的に掘り下げることで、一人ひとりに適切な治療方針を導きます。培養検査では見落とされがちなカンジダ感染や、腸内細菌叢の微妙な乱れまで評価できる点が強みです。
SIBOの治療法(食事・薬剤・サプリ・生活改善)
SIBOと診断された場合、治療は大きく分けて2つの柱があります。ひとつは食事療法(腸内細菌のエサになる発酵性の糖質を減らすなど)、もうひとつは腸内細菌や腸の動きを整える治療です。当院では患者様の状態に合わせて、以下のようなアプローチを組み合わせています。
(1) 食事療法:低FODMAP食の導入
低FODMAP食とは、小腸で発酵されやすい特定の糖質類(発酵性オリゴ糖・二糖類・単糖類・ポリオール類=FODMAP)を控える食事法です。これによって腸内ガスの過剰産生を抑え、症状の悪化を防ぐことができます。SIBOの食事療法として有効性が高く、海外のガイドラインでも推奨されています。
具体的には、玉ねぎやニンニク、小麦、乳製品(乳糖)、果糖の多い果物、豆類などを一時的に制限し、症状が落ち着いてから少しずつ再開します。例えばパンやパスタなど小麦を含む食品は控え、米や雑穀を主食にする、乳製品の代わりに豆乳やアーモンドミルクを使う、といった工夫をします。
ただし、絶対に食べてはいけないものかというと、必要以上にすべての高FODMAP食品を避ける必要はありません。あくまで症状が落ち着くまでの一時的な措置として取り入れ、腸内環境が改善したら栄養バランスに配慮しつつ徐々に制限を緩めていく方針をとっています。完全除去ではなく、「適度に控える」ことがポイントです。厳密な低FODMAP食の実践が難しい場合は、まず小麦製品を避ける(グルテンフリー)、乳製品を避ける(カゼインフリー)といった比較的取り組みやすい方法から始め、ご自身の体調変化を見ながら原因となっている可能性のある食品を特定していくのも一つの方法です。
※詳しい低FODMAP食品・高FODMAP食品のリストをご覧になりたい方は以下をクリックしてください。
✗制限される食品(高FODMAP) | ◯推奨される食品(低FODMAP) |
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乳製品
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乳製品代替品
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野菜
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低FODMAP野菜
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果物
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低FODMAP果物
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穀物・でんぷん
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穀物・でんぷん類
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飲み物
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低FODMAP飲み物
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(2) 薬物療法・ハーブ療法
抗生剤による除菌:一般的にはリファキシミン(非吸収性抗生物質)やメトロニダゾールなどを用いて、小腸内の細菌数を直接減らす治療が行われます。例えば、GIMAP検査でMethanobacteriaceaeという種類の菌が多く検出された場合には、リファキシミンが選択されることがあります。

ただし抗生剤は繰り返すたびに効果が落ちやすいため、最初の治療が肝心です。むやみに乱用せず、事前にGIMAP検査などで増殖している菌を特定した上で「本当に必要な場合にのみ使う」ことを大切にしています。
ピロリ菌の除菌:内視鏡検査などでは見つけにくいケースですが、ピロリ菌感染がSIBOの一因となっていることもあります。胃酸低下を招くピロリ菌が存在する場合は、適切な除菌治療を検討します。内視鏡で正常と判断されてもGIMAPで検出されることも多く注意が必要です。当院では、SIBOの方に対してGIMAP検査によるピロリ菌の精密な検出に力を入れており、陽性の場合は除菌を行うことでSIBO症状の改善が見られるケースも経験しています。

抗真菌薬やハーブ療法:検査の結果、腸カンジダなど真菌(カビ類)の異常増殖が主な原因と考えられる場合は、抗真菌薬(ナイスタチン等の抗カビ剤)を使用します。この場合、SIBOの治療と並行してカンジダの除菌も行う必要があります。薬に加えてオリーブ、オレガノオイルなどハーブ系のサプリメントも組み合わせ、小腸内の真菌や細菌叢の是正を図ることもあります。
腸の運動を促す薬:小腸の蠕動運動を改善する薬剤(消化管運動促進薬)を併用し、腸内容物のうっ滞を防ぐことで再発予防に努めます。例えばモサプリドなどのお薬で胃腸の動きをサポートするケースがあります。(SIBO除菌が困難なパターンの多くは、胃酸低下の原因(低血糖、ストレス、副腎疲労など)や生活習慣が関与しているため、これらへの対処も重要です。治療ではありませんが、大腸内視鏡検査の前処置で下剤を服用することにより、腸内細菌が一掃され、結果的にSIBOの症状が改善する方もいらっしゃいます。)

(3) サプリメントと腸粘膜ケア
消化酵素の補助:膵酵素製剤や胆汁酸のサプリメントを用いて消化を助けると、腸内で未消化のまま発酵する物質が減るためガス発生を抑制できます。特に脂肪やタンパク質の消化が不十分な方には有用です。
腸粘膜の修復サポート:L-グルタミン、亜鉛、ビタミンA・Dなど腸の粘膜バリアを修復・強化するサプリを用いて、小腸の粘膜環境を整えます。これによりリーキーガット(腸もれ)の改善も期待できます。
プロバイオティクスの活用:善玉菌のサプリメント(プロバイオティクス)はタイミングが重要です。小腸にまだ細菌過多の状態でむやみにプロバイオティクスを投与すると、かえってガス産生が増えて症状悪化する可能性があります。そのため、症状が強い治療初期には敢えて控え、抗菌治療などである程度菌バランスが整った段階で導入するなどの調整が必要です。
(4) ストレス管理・生活習慣の改善
- ストレスコントロール:精神的ストレスや睡眠不足は腸の蠕動運動を低下させる大きな要因です。日々の中でリラックスできる時間を作ったり、深呼吸や瞑想などで自律神経のバランスを整えましょう。十分な睡眠をとることも腸の健康には不可欠です。
- 適度な運動と腸への刺激:軽い有酸素運動(ウォーキングやヨガなど)を習慣にすると腸の動きが活発になり、ガスの排出も促されます。また、お腹のマッサージ(のの字マッサージ)や腹式呼吸も腸への適度な刺激となり、便通改善に役立ちます。無理のない範囲で体を動かす習慣をつけましょう。

SIBOの予防策と腸活・菌活との関係
● 腸活・菌活が逆効果になるケースも
- 発酵食品や善玉菌サプリの摂りすぎに注意:前述の通り、SIBOの人が納豆、ヨーグルトやキムチ、味噌、乳酸菌サプリメントなど大量の発酵食品やプロバイオティクスを摂取すると、小腸内の細菌まで必要以上に増殖してしまい症状が悪化する可能性があります。「体に良いはず」と思って続けていても改善しない場合は要注意です。特に、元々胃腸が強い(胃酸がしっかり分泌され、消化酵素も十分で、食べたものをきちんと消化できる)方でない場合や、既に下痢や便秘といった不調を抱えている方が自己判断で積極的な腸活を行うと、かえってSIBOを悪化させるリスクがあります。
- まずは専門的な検査を受けること:腸活そのものを否定する必要はありませんが、自己判断で闇雲に発酵食品を摂る前に一度SIBOを疑ってみることが大切です。専門医の診断のもと自分の腸内環境を把握した上で、「腸活」や「菌活」に取り組むのが安全と言えます。
● 日常生活でできる再発防止策
SIBOは再発しやすい側面もあるため、日頃から腸に負担をかけない生活習慣を心がけましょう。特に以下のようなポイントに注意すると予防につながります。
- 胃酸抑制薬の長期使用を見直す(必要以上にPPIなどを漫然と使わないよう、主治医と相談して減量を検討)
- 1日3食を規則正しく(ドカ食いや早食いは避け、食事間隔が空きすぎないようにする)
- よく噛んで腹八分目で食べる(消化を助け、過剰な内容物停滞を防ぐ)
- こまめな水分補給と適度な運動を習慣に(腸の動きを促し、便通をスムーズに保つ)
- 慢性ストレスを溜めない(趣味やリラクゼーションの時間を持ち、しっかり休息をとる)
これらを実践することで、小腸の内容物の流れが良くなり細菌増殖のリスクを低減できます。日々の心がけが再発予防に繋がります。

つらい症状、諦めないでご相談ください
SIBO(小腸内細菌増殖症)は、お腹の張りや痛み、下痢や便秘といった一般的な胃腸症状だけでなく、原因不明の倦怠感や集中力の低下など、日常生活に支障をきたす多様な症状を引き起こします。
「体質だから仕方ない」「ストレスのせいだろう」と諦めていたその症状、もしかしたらSIBOが原因かもしれません。胃酸の分泌低下、消化酵素の働きの低下、腸の動きの悪さなど、SIBOを引き起こす要因は様々です。
当クリニックでは、SIBOの診断に有用な検査をはじめ、患者様お一人おひとりの状態を総合的に評価し、根本的な原因を探ります。その上で、食事療法、薬物療法、運動療法、生活習慣の改善などを組み合わせた、最適な治療プランをご提案いたします。
SIBOは慢性的な症状につながることもありますが、早期に適切な診断と治療を行うことで、症状の改善が期待できます。「もしかして?」と思ったら、自己判断せずに、まずは一度、当クリニックにご相談ください。つらい症状を改善し、快適な毎日を取り戻すためのお手伝いをさせていただきます。まずはお気軽にご予約の上、ご来院ください。
検査や治療は栄養外来で行っています。気になる症状などがあれば、お問い合わせ(お問い合わせフォーム)ください。

よくある質問(FAQ)
Q1. SIBOは自己判断で治せますか?
A. 軽症のSIBOであれば、食事内容の見直し(低FODMAP食など)によって一時的に症状が和らぐことがあります。しかし、根本原因である細菌バランスが崩れた状態が続いていると、どうしても再発しやすく根本的な改善が難しい場合が多いです。原因となっている菌種が特定できないまま自己流の腸活を続けると、かえって症状を悪化させてしまうリスクもあります。そのため、専門医による検査と指導を受けることをおすすめします。適切な検査で原因菌を突き止めた上で、食事療法や必要に応じた薬物療法を組み合わせることで再発しにくい状態を目指せます。
Q2. 過敏性腸症候群(IBS)とどう違いますか?
A. IBSはストレスなどによる腸の機能異常が主な原因で、検査をしても炎症や感染など明らかな異常が見つからない機能性疾患です。一方SIBOは小腸での細菌異常増殖が原因となる疾患です。ただし症状が似ており、ストレスや食事など誘因もオーバーラップしていることが多いのが実情です。そのため当院では両者を無理に切り分けず、まずは腸内環境の詳細検査を行って問題のある菌(細菌・真菌)を突き止め、IBSかSIBOかにかかわらず原因にアプローチする治療を行っています。実際、IBSと診断され長く苦しんでいた方がSIBO治療で改善するケースも多く経験しています。
Q3. 発酵食品やプロバイオティクスは控えたほうがいいの?
A. SIBOの進行度や治療段階によります。症状が強い治療初期には、発酵食品やプロバイオティクスを一時的に控えて悪化を防ぐケースが多いです。腸内に余分な発酵源を入れないことでガス産生を抑える狙いです。ただし、腸内細菌バランスが整ってきた後は少しずつ再開する場合もあります。一概に「一生やめるべき」というものではありません。自己判断せず担当医に経過を相談しながら再開のタイミングを決めると安心です。
Q4. 検査は保険診療で受けられますか?
A. 残念ながら、SIBOの検査の多くは現在保険適用外(自費扱い)となっています。例えば前述のGIMAPなどの遺伝子解析による便検査や、有機酸検査(OAT)は自費検査です。当院でも自由診療として実施しております。
Q5. どのくらいで治りますか?
A. 個人差が大きいですが、軽症であれば数ヶ月程度の食事療法・抗菌療法で症状がかなり改善することもあります。ただし、症状が良くなった後も再発を防ぐために生活習慣やストレス管理も含めた総合的なケアが必要です。長年かけて生じた腸内環境の乱れを整えるには、それ相応の時間も要します。また、ストレスが多かったり全身的な疲労(例えば【副腎疲労】など)が強い場合には、腸だけでなくホルモンバランスや自律神経の乱れも関与しているため、改善に時間がかかることが多いです。当院では栄養療法なども組み合わせて全身状態の立て直しを図りながら治療を行っています。
最後に(免責)
本記事の内容は、医学的治療に置き換わるものではありません。個人的にお試しになり健康被害が生じても、当院では一切責任を負えませんのでご了承下さい。
病態の改善に必要な食事・サプリメントはひとりひとり異なります。
基本的に、主治医と相談しながら治療を進めていただければと思います。
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執筆者 篠原 岳:1975年横浜生まれ、2021年9月に東京原宿クリニックを開設。内科医、呼吸器内科専門医、アレルギー専門医として豊富な経験を持つ。現在は、一般内科診療をはじめ、栄養療法・点滴療法、カウンセリングを組み合わせた総合的な健康サポートを行いながら、患者さん一人ひとりの生活の質向上をサポート。自身の体調不良経験から、従来の西洋医学に加え、栄養療法の重要性を実感。最新の医学知識の習得に励み、患者さんにとってより良い医療の提供に取り組んでいる。医学博士、日本内科学会総合内科専門医、日本呼吸器学会専門医、日本アレルギー学会アレルギー専門医、臨床分子栄養医学研究会認定指導医。